了尘兰若的小坑

2021-10-20

有时候需要在FASTA格式的文件中搜索短的保守序列，这个时候采用查找法比使用blast等序列比对更加人性化。但是要注意避坑，即FASTA文档中的序列一般是被打断为许多行的，如果要查找的目标序列恰好在断行处，是没有办法直接揪出它的，所以在查找

2021-10-19

sakuraplus主题默认是不显示表格边框的，而且对于比较宽的表格容易溢出，使得布局不美观。表格边框可以修改CSS来添加，较宽的表格可以通过添加滚动条来控制其不溢出，说起来简单，但是中间有很多坑，特此记录。添加表格边框该主题默认的sty

2021-10-14

Subtitle: Predict Secretory Protein in microbes with SignalP and TMHMM 分泌蛋白Secretory Protein是指在细胞内合成后，分泌到细胞外起作用的蛋白质。分泌蛋白

2021-10-13

III 型分泌系统 (Type III secretion system，T3SS) 主要是革兰氏阴性菌的分泌蛋白分泌到细胞外的运输途径，T3SS效应蛋白 (Type III secretion system Effector protei

2021-10-12

气泡图是经常用到的一种图，可以对比不同样本中某个特征的丰富度差异。以下代码“bubbleChart_No0.R”用于气泡图的绘制，零值将不会在图中输出。 bubbleChart_No0.R代码在此123456789101112131415

2021-10-09

二话不说，上代码，需要安装BioPerl 123456789101112131415161718192021#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;use Bio::SeqIO;# Author: Li

2021-10-09

当一个基因组含有多个Contigs/Scaffolds的时候，在GenBank文件中也会产生多个LOCUS。某些软件会将GenBank文件作为输入，但仅支持一个GenBank文件中只包含一条Contig/Scaffold

2021-10-08

软件 (Software needed) IslandPath-DIMOB BioPerl 安装 (Installation)12conda install islandpathconda install perl-bioperl 输入

2021-10-08

本文介绍如何从细菌/古菌中预测前噬菌体。软件选择 PhiSpy BioPerl 软件安装安装主程序推荐使用conda 12conda install phispyconda install perl-bioperl 下载模

2021-09-30

Hexo渲染异常

代码渲染问题代码块中的花括号{}被渲染为’{’和’}’ 原因安装了代码高亮插件(hexo-prism-plugin)导致的错误解决方案卸载该插件，然后重新渲染。 1npm uninst

可怕的不是别人，是心魔，成功者自救