2021-09-27扩增子系之绘制物种分类堆叠图R语言SY179扩增子 可视化为何要手绘堆叠图? QIIME2 虽然可以生成堆叠图,然而图片只能在网页上查看,无法下载。此外,QIIME2 的图有几分丑,且不可个性化修改,因此,手绘最靠谱。手绘当然不是用手画,而是用手敲代码。 输入文件 各级别的物种分布文件,可以直
2021-09-15扩增子可视化专题R语言SY179扩增子 可视化扩增子分析较常用的软件是 QIIME2,然而其生成的图并不美观,且无法下载,是不可能够达到发表要求的,因此需要我们通过其他方法将 QIIME2 生成的数据结果进行可视化。本文将记录相关的分析方法和示例。 准备数据 特征表(Feature
2021-03-25扩增子分析--计算随机过程和决定性过程比例扩增子 生物信息确定性过程(deterministic processes)和随机性过程(stochastic processes) 是两个影响微生物群落结构系统发育组装的重要过程,本文介绍计算二者所占比例的方法。