2021-11-26R语言绘制分组条形图R语言SY179绘图 可视化当我们要对一个多行多列的数据进行可视化的时候,分组条形图是一种不错的选择。 输入文件样式 本例中数据内容如下图所示,将其保存在名为 CAZy.Category.Matrix.txt 的文件中。 绘图代码 在 Rstudio 中运行如
2021-11-02R语言安装依赖包错误集锦LinuxR语言软件 生物信息devtools 安装错误 XML 包 安装之 ERROR: configuration failed for package ‘XML’ CentOS 解决方案 在 Linux 终端中运行如下命令即可: sudo yum inst
2021-11-02在Linux服务器中安装网页版RstudioLinuxR语言软件 生物信息本文演示如何在 CentOS7 服务器上安装 Rstudio server。 安装 Rstudio 访问 Rstudio 官网,选择对应的 Linux 发行版,下载 Rstudio 安装包。本文以最常见的 CentOS7 为例演示,前提是
2021-10-12R语言绘制气泡图Bubb_PlotR语言绘图 可视化气泡图是经常用到的一种图,可以对比不同样本中某个特征的丰富度差异。以下代码 “bubbleChart_No0.R” 用于气泡图的绘制,零值将不会在图中输出。 bubbleChart_No0.R代码在此#!/usr/bin/env Rscr
2021-09-27扩增子系之绘制物种分类堆叠图R语言SY179扩增子 可视化为何要手绘堆叠图? QIIME2 虽然可以生成堆叠图,然而图片只能在网页上查看,无法下载。此外,QIIME2 的图有几分丑,且不可个性化修改,因此,手绘最靠谱。手绘当然不是用手画,而是用手敲代码。 输入文件 各级别的物种分布文件,可以直
2021-09-15扩增子可视化专题R语言SY179扩增子 可视化扩增子分析较常用的软件是 QIIME2,然而其生成的图并不美观,且无法下载,是不可能够达到发表要求的,因此需要我们通过其他方法将 QIIME2 生成的数据结果进行可视化。本文将记录相关的分析方法和示例。 准备数据 特征表(Feature
2021-09-08绘图自定义colorsR语言 可视化在绘图过程中经常需要为不同的对象分配不同的 color,然而如何得到对比度高又不唐突的 color 组合是一门艺术。对于不懂美术的理工男来说,希望有现成的 color sets 可用。
2019-02-22R语言自定义坐标轴排序R语言绘图 可视化R 语言作图时,默认情况下软件会按照自己的方式对坐标轴的项目进行排序,然而这种排序往往不是我们所希望的,因此需要想办法让坐标轴的项目按照我们希望的顺序输出。