关于我

刘华林

教育经历

	2012-09 至 2019-12	华中农业大学	硕士+博士	微生物学
	2008-09 至 2012-06	枣庄学院	学士	生物技术

工作经历

	2022-08 至今	完美（广东）日用品有限公司	创新研究专业经理	生物信息团队负责人
	2020-08 至2022-07	中山大学	博士后	海洋生态基因组

专业技能

微生物基因组学、比较基因组学、微生物组学（扩增子&宏基因组学）、代谢组学、生物信息学管道开发、机器学习、AI工具使用

IT

证书

CET4、CET6、NCRE1、NCRE2（C语言）、NCRE4（网络工程师）、普通话等级证书、驾驶证、AIGC-ChatGPT应用工程师、Python应用工程师、AIGC与大模型通识-英特尔大湾区科技创新中心证书认证、机器学习+深度学习应用工程师

荣誉

2018-11　优秀学术报告天津市微生物学会 | 奖励描述：第十三届全国芽胞杆菌青年工作者学术研讨会
2018-07　优秀讲师华中农业大学 | 奖励描述：JC Bioinformatics 2018暑期班
2018-05　优秀博士生华中农业大学 | 奖励描述：生命科学技术学院2018年“优秀博士生培养计划”
2017-06　三好研究生华中农业大学 | 奖励描述：2016-2017学年度研究生先进个人评选
2016-11　三好研究生华中农业大学 | 奖励描述：2015-2016学年度研究生先进个人评选
2015-12　先正达齐尔顿研究生奖学金华中农业大学 | 奖励描述：8000元奖学金
2014-12　科研积极分子华中农业大学 | 奖励描述：学校2013-2014年度研究生先进个人评选
2009-06　实习先进个人枣庄学院 | 奖励描述：生命科学系野外实习
2009-06　宿舍文化节原创作品类二等奖枣庄学院 | 奖励描述：枣庄学院第四届大学生宿舍文化节
2009-04　最佳搞笑奖枣庄学院 | 奖励描述：枣庄学院生命科学系第二届“相声小品大赛”

项目&实践

2022.08- ：负责完美公司生物信息学平台搭建。包括服务器集群购买、管理和生信分析管道开发。
2018.11：第七届全国微生物基因组学学术研讨会-微生物基因组学培训主讲人。讲解常用的微生物基因组学相关软件的安装及使用。
2018.07：JC Bioinformatics 2018暑期班主讲人。讲解16S rRNA扩增子测序的原理以及基于QIIME2 软件的分析方法。
2017.07：微生物基因组学培训第一期主讲人。讲解常用的微生物基因组学相关软件的安装及使用。
2012.12-2017.11：先正达苏云金芽胞杆菌新型杀虫蛋白基因发掘。平台建设人之一，负责生物信息学分析与相关pipeline（BtToxin_Digger 和 PGCGAP）的开发。

参会&竞赛

时间	地点	会议名称	是否作报告	报告题目
2024.02.25-28	博鳌亚洲论坛国际会议中心@琼海	博鳌健康食品科学大会暨博览会	否	-
2023.06.07	完美（广东）日用品有限公司@中山	抗衰老国际会议：衰老机制与干预	否	-
2023.02.22-25	博鳌亚洲论坛国际会议中心@琼海	博鳌健康食品科学大会暨博览会	否	-
2022.05.15	线上@北京-中国农业科学院植物保护研究所	第十七届全国芽胞杆菌青年工作者学术研讨会	否	-
2021.11.19-20	线上 @扬州 - 江苏省农业科学院植物保护研究所	第十六届全国芽胞杆菌青年工作者学术研讨会	否	-
2020.11.22	线上 @武汉 - 华中农业大学	第十五届全国芽胞杆菌青年工作者学术研讨会	否	-
2019.10.18	中山大学 @珠海	“科技创新与未来海洋”—— 海洋科学与工程全国博士后学术论坛	是	苏云金芽胞杆菌的多样性及其生物地理学
2018.11.28-12.02	江西农业大学 @南昌	第七届全国微生物基因组学学术研讨会	是	举办微生物基因组学培训班
2018.11.09-11	南开大学 @天津	第十三届全国芽胞杆菌青年工作者学术研讨会	是	苏云金芽胞杆菌的多样性及其生物地理学
2016.7.17-19	中国科学院上海生科院植物生理生态研究所 @上海	第六届全国农业微生物研究及产业化研讨会暨第十五届全国杀虫微生物学术研讨会与第十一届全国虫生真菌学术研讨会	否	-
2015.12.19	华中农业大学 @武汉	第二届 “菲沙杯” 生物信息项目设计大赛	是	以子之矛攻子之盾 —— 浮游生物群落动态分析揭示藻华成因与治理策略的提出
2015.11.21-22	中国科学院武汉病毒研究所 @武汉	第十届全国芽胞杆菌青年工作者学术研讨会	否	-
2015.03.28	华中农业大学 @武汉	第二届国际 & 华中地区生物信息学研讨会	否	-

发表文章

红色字体标记本人为一作，*：代表共同第一作者

Zhang Fu , Xiuyan Yang , Youheng Jiang , Xinliang Mao, Hualin Liu , Yanming Yang , Jia Chen , Zhumei Chen , Huiliang Li , Xue-Song Zhang , Xinjun Mao , Ningning Li , Dilong Wang and Jian Jiang. Microbiota Profiling Reveals Alteration of Gut Microbial Neurotransmitters in a Mouse Model of Autism-Associated 16p11.2 Microduplication. Frontiers in Microbiology, 15:1331130. doi: 10.3389/fmicb.2024.1331130. (Published: 26 March 2024) IF2023: 6.064
Hualin Liu, Xueyu Cai, Kunwen Luo, Sihan Chen, Ming Su and Jianguo Lu. (2023) Microbial diversity, community turnover and putative functions in submarine canyon sediments under the action of sedimentary geology revealed by amplicon and metagenomic sequencing. Microbiology Spectrum, 11(2):e04210-22. doi: 10.1128/spectrum.04210-22 (Published: 21 February 2023) IF2022: 9.043 中科院大类-生物-1区 [微生物学1区] 引用 1
Hualin Liu, Genmei Lin, Dong Gao, Hongyu Chen, Miao He and Jianguo Lu. (2023) Geographic Scale Influences the Interactivities Between Determinism and Stochasticity in the Assembly of Sedimentary Microbial Communities on the South China Sea Shelf. Microbial Ecology, 85(1):121-136. doi: 10.1007/s00248-021-01946-x (Online: 18 January 2022，Published：January 2023) IF2022: 4.192 中科院大类-生物-2区TOP [MICROBIOLOGY微生物学3区，MARINE & FRESHWATER BIOLOGY海洋与淡水生物学1区，ECOLOGY生态学3区] 引用 6
Shu Liu, Shulin Deng, Hualin Liu, Liang Tang, Mengqi Wang, Bingyue Xin, Feng Li. (2022) Four Novel Leaderless Bacteriocins, Bacin A1, A2, A3, and A4 Exhibit Potent Antimicrobial and Antibiofilm Activities against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus. Microbiology Spectrum, 10(5):e00945-22. doi: 10.1128/spectrum.00945-22 (Published: 24 August 2022) IF2022: 9.043 中科院大类-生物-1区 [微生物学1区]
Shulin Deng, Shu Liu, Xiang Li, Hualin Liu, Feng Li, Kexin Liu, Huawei Zeng, Xin Zeng, Bingyue Xin. (2022) Thuricins: Novel Leaderless Bacteriocins with Potent Antimicrobial Activity Against Gram-Positive Foodborne Pathogens. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 70(32):9990-9999. doi: 10.1021/acs.jafc.2c02890(Published: 4 August 2022) 中科院1区
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Bingyue Xin, Haitao Xu, Hualin Liu, Shu Liu, Juanjuan Wang, Jianping Xue, Fei Zhang, Shulin Deng, Huawei Zeng, Xin Zeng, Dayong Xu, Yi Zhao, Feng Li* and Guangli Wang*. (2020) Identification and characterization of a novel circular bacteriocin, bacicyclicin XIN-1, from Bacillus sp. Xin1. Food Control. 2020:107696. doi: 10.1016/j.foodcont.2020.107696 (Published: March 2021) IF2022: 6.652, 中科院大类-2区 [FOOD SCIENCE & TECHNOLOGY食品科技2区]
Bingyue Xin*, Hualin Liu*, Jinshui Zheng, Chuanshuai Xie, Ying Gao, Dadong Dai, Donghai Peng, Lifang Ruan, Huanchun Chen and Ming Sun. (2020) In silico analysis highlights the diversity and novelty of circular bacteriocins in sequenced microbial genomes. mSystems. 5(3). doi: 10.1128/mSystems.00047-20 (Published: 02 June 2020) IF2022: 7.324, 中科院大类-生物-2区 [MICROBIOLOGY微生物学2区] 引用 30
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Muhammad Sajid, Ce Geng, Miaomiao Li, Yueying Wang, Hualin Liu, Jinshui Zheng, Donghai Peng and Ming Sun (2018). Whole genomic analysis of Bacillus thuringiensis revealing partial genes as a source of novel Cry toxins. Applied and Environmental Microbiology, 2018, 84(14). doi: 10.1128/aem.00277-18 (Published: 02 July 2018) IF2022: 5.005 中科院大类-生物-2区TOP [MICROBIOLOGY微生物学3区，BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY生物工程与应用微生物2区] EI收录
Jinshui Zheng, Qiuling Gao, Linlin Liu, Hualin Liu, Yueying Wang, Donghai Peng, Lifang Ruan, Ben Raymond and Ming Sun. (2017). Comparative genomics of Bacillus thuringiensis reveals a path to specialized exploitation of multiple invertebrate hosts. Mbio, 8(4), e00822-17. doi: 10.1128/mBio.00822-17 (Published: 08 August 2017) IF2022: 7.786, 中科院大类-生物-2区 [MICROBIOLOGY微生物学2区]
Bingyue Xin, Jinshui Zheng, Hualin Liu, Junhua Li, Lifang Ruan, Donghai Peng, Muhammad Sajid and Ming Sun. (2016) Thusin, a Novel Two-Component Lantibiotic with Potent Antimicrobial Activity against Several Gram-Positive Pathogens. Frontiers in Microbiology. 7:1115. doi: 10.3389/fmicb.2016.01115 (Published: 19 July 2016) IF2022: 6.064, 中科院大类-生物-2区TOP [MICROBIOLOGY微生物学2区]
Ziqiang Zheng, Jinshui Zheng, Hualin Liu, Donghai Peng and Ming Sun. (2016). Complete genome sequence of Fictibacillus phosphorivorans G25-29, a strain toxic to nematodes. Journal of Biotechnology, 239, 20-22. doi: 10.1016/j.jbiotec.2016.09.014 (Published: 10 December 2016) IF2022: 3.595, 中科院大类-工程技术-3区 [BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY生物工程与应用微生物3区] EI收录
Guoqiang Liu, Yingying Kong, Hualin Liu, Donghai Peng, Lifang Ruan, Yiming Wu and Ming Sun. (2016). Incidental mutations occur frequently during transposon mutagenesis. Fems Microbiology Letters, 364(3). doi: 10.1093/femsle/fnw293 (Published: 01 February 2017) IF2022: 2.820, 中科院大类-生物-4区 [MICROBIOLOGY微生物学4区]
Yueying Wang, Jingjing Fu, Qian Zhu, Lei Zhu, Jinshui Zheng, Hualin Liu, Donghai Peng, Lifang Ruan and Ming Sun. (2016). Complete genome sequence of Bacillus thuringiensis serovar alesti BGSC 4C1, a typical strain with toxicity to Lepidoptera insects. Journal of Biotechnology, 239, 61-64. doi: 10.1016/j.jbiotec.2016.09.015 (Published: 10 December 2016) IF2022: 3.595, 中科院大类-工程技术-3区 [BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY生物工程与应用微生物3区] EI收录
Jinshui Zheng, Donghai Peng, Ling Chen, Hualin Liu, Feng Chen, Mengci Xu, Shouyong Ju, Lifang Ruan and Ming Sun. (2016). The Ditylenchus destructor genome provides new insights into the evolution of plant parasitic nematodes. PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES,283(1835), 20160942. doi: 10.1098/rspb.2016.0942 (Published: 27 July 2016) IF2022: 5.530, 中科院大类-生物-2区TOP [EVOLUTIONARY BIOLOGY进化生物学2区，ECOLOGY生态学2区，BIOLOGY生物学2区]

预印本：

Hualin Liu*, Bingyue Xin*, Jinshui Zheng, Hao Zhong, Yun Yu, Donghai Peng, Ming Sun. Build a Bioinformatic Analysis Platform and Apply it to Routine Analysis of Microbial Genomics and Comparative Genomics, 24 April 2022, PROTOCOL (Version 6) available at Protocol Exchange https://doi.org/10.21203/rs.2.21224/v6 引用 26

谷歌学术：

引用次数

	总计	2019 年至今
引用	386	352
h 指数	10	10
i10 指数	11	11

主持项目

暂无

参与项目

南方海洋科学与工程广东省实验室（珠海）2021年度自主科研项目，神狐陆坡峡谷群复杂地形条件下沉积动力过程及生态环境响应，2021-10-11 至 2024-09-30，100万，在研，参与
国家自然科学基金委员会, 面上项目, 31770003, 苏云金芽胞杆菌H-血清型决定的遗传基础研究, 2018-01-01 至 2021-12-31, 64万元, 在研, 参与
国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 31500003, 基于基因组的苏云金芽胞杆菌资源的多样性研究, 2016-01-01 至 2018-12-31, 18万元, 结题, 参与