2022-02-26
EggNOG-mapper 简介 (本文未完待续...) EggNOG-mapper (a.k.a. emapper.py or just emapper) is a tool for fast functional annotation
了尘兰若的小坑
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Functional genomics 分类
2021-11-25
氮（N）循环是地球生态系统中重要的生物地球化学途径的集合，在生态学和环境研究中得到了广泛的关注。目前，鸟枪法宏基因组测序Shotgun metagenome sequencing已被广泛应用于探索负责 N 循环过程的基因家族。NCycDB
2021-10-14
Subtitle: Predict Secretory Protein in microbes with SignalP and TMHMM 分泌蛋白Secretory Protein是指在细胞内合成后，分泌到细胞外起作用的蛋白质。分泌蛋白
2021-10-13
III 型分泌系统 (Type III secretion system，T3SS) 主要是革兰氏阴性菌的分泌蛋白分泌到细胞外的运输途径，T3SS 效应蛋白 (Type III secretion system Effector prote
2021-10-08
软件 (Software needed) IslandPath-DIMOB BioPerl 安装 (Installation) conda install islandpath conda install perl-bioperl
2021-09-30
CAZy 数据库简介 CAZy 全称为 Carbohydrate-Active enZYmes Database，碳水化合物酶相关的专业数据库，内容包括能催化碳水化合物降解、修饰、以及生物合成的相关酶系家族。其包含五个主要分类：糖苷水解酶
2021-09-28
数据库下载与构建 下载 wget https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.fa
2020-11-04
BtToxin_Digger is the latest high-throughput Bacillus thuringiensis virulence factor mining pipeline on the whole network, including the basic web version and the local advanced version.
