标签: perl | 了尘兰若的小坑

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2021-10-09

二话不说，上代码，需要安装 BioPerl #!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use Bio::SeqIO; # Author: Liu hualin # Date: Oct 9, 2021

2021-10-09

当一个基因组含有多个 Contigs/Scaffolds 的时候，在 GenBank 文件中也会产生多个 LOCUS。某些软件会将 GenBank 文件作为输入，但仅支持一个 GenBank 文件中只包含一条 Contig/Scaffold

2021-09-29

承接上一篇文章 Swissprot 数据库的本地化与序列比对。应用场景分别预测了多个样本 / 基因组中某些基因的存在与否即数量，需要将这些样本 / 基因组中的基因数量情况合并在一起构建矩阵，此时，手动是非常困难和无趣的。又该请出 Pe

2021-09-27

每次在 Windows 下运行 Perl，或者通过 Perl 处理 Windows 系统生成的文件时，行尾总会有隐藏的换行符删不掉，chomp 毛用都没有。处理后的文件在文本阅读器如 TXT、EditPlus 等中是看不到换行符的，然而当将

2019-04-19

有时候 perl 脚本需要与 Linux 外部命令进行交互，本文讲解如何将外部命令的执行结果的输出（此处指的不是运行结果的返回值，而是标准输出上的内容之类）赋给 perl 变量。

2019-04-19

在编写 perl 脚本时经常会调用外部命令，由于种种原因，会遇到外部命令执行异常，而导致整个脚本终止运行。这对于大的项目来说很不经济，因此，可以想办法越过这个异常并继续执行后续脚本。