R语言安装依赖包错误集锦
发表于:2021-11-02 | 分类: 生物信息
字数统计: 159 | 阅读时长: 1分钟 | 阅读量:

devtools安装错误

XML包 安装之 ERROR: configuration failed for package ‘XML’

  • CentOS解决方案

    在Linux终端中运行如下命令即可:

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    sudo yum install -y libxml2-devel

qiime2R安装错误

rjcommon.h:11:21: fatal error: jpeglib.h: No such file or directory

该错误是安装依赖包“jpeg”时发生的。

  • CentOS解决方案

    在Linux终端中运行如下命令即可:

    1
    sudo yum install sudo yum install -y libjpeg-turbo-devel.x86_64

WGCNA安装错误

Warning in install.packages :
没有’‘impute’, ‘preprocessCore’, ‘GO.db’, ‘AnnotationDbi’’这种相依关系

  • 解决方案:在R环境下通过BiocManager安装GO.db
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    if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

    BiocManager::install(c("GO.db", "impute", "preprocessCore"))
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