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2024-07-30 用MaAsLin2包做微生物组多变量线性模型关联分析 R语言扩增子生信软件 生物信息 简介MaAsLin 2 是 MaAsLin(微生物组多变量线性模型关联,Microbiome Multivariable Association with Linear Models)的下一代产品。 MaAsLin 2 是一个全面的 R 语
2023-04-19 基于TidyMass的非靶向代谢组学分析 代谢组生信软件 生物信息 代谢组学常用仪器特点 仪器 特点 GC-MS 易挥发,低极性,热稳定的小分子化合物;需衍生化 LC-MS 具有一定极性的有机化合物;无需衍生化 NMR 无偏性,无损检测;•无需繁琐前处理,便于活体、原位的动态检测 CE-M
2023-04-17 用metid构建代谢组数据库 代谢组学生信软件 生物信息 安装metid包能够用于in-house代谢物库构建,并可利用MS2 spectra进行代谢物鉴定。metid自带数据库,来自于公共数据库的整合。 1234if(!require(remotes)){install.package
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2023-02-02 代谢组相关软件的安装及使用 代谢组生信软件 生物信息 软件安装MZconvert下载ProteoWizard项目下的Linux native 64-bit,上传至服务器并解压缩 (会将所有文件解压至当前目录,建议提前单独建一个目录),解压后的文件即为可执行程序,需将该目录写入环境变量。 1ta
2022-03-15 PGCGAP - the Prokaryotic Genomics and Comparative Genomics Analysis Pipeline v1.0.33 PGCGAPWGS比较基因组学生信软件 生物信息 English Readme | 中文说明 ____ ____ ____ ____ _
2022-02-26 Nanopore基因组组装 WGS生信软件 生物信息 安装软件123456789mamba install miniasm minipolish raven-assembler flye medaka python=3.8 fastp bwa masurca trycyclergit clon
2022-02-26 使用eggNOG-mapper注释基因组 Functional genomicsWGS生信软件 生物信息 EggNOG-mapper简介(本文未完待续…)EggNOG-mapper (a.k.a. emapper.py or just emapper) is a tool for fast functional annotation of no
2022-01-07 使用DeepARG预测抗生素抗性基因ARGs ARGs生信软件 生物信息 介绍DeepARG 是一种机器学习解决方案,它使用深度学习来表征和注释宏基因组中的抗生素抗性基因。它由两种输入模型组成:短序列Reads和gene-like序列。 安装软件 通过conda安装 12345678910111213141