代谢组相关软件的安装及使用
发表于:2023-02-02 | 分类: 生物信息
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软件安装

MZconvert

下载ProteoWizard项目下的Linux native 64-bit,上传至服务器并解压缩 (会将所有文件解压至当前目录,建议提前单独建一个目录),解压后的文件即为可执行程序,需将该目录写入环境变量。

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tar jxvf pwiz-bin-linux-x86_64-gcc7-release-3_0_23032_0cc4840.tar.bz2

:在运行msconvert时,如果遇到报错terminate called after throwing an instance of 'std::runtime_error'what(): locale::facet::_S_create_c_locale name not valid,则在终端里运行命令export LC_ALL=C(去除所有本地化的设置,让命令能正确执行),为了永远生效,可将此命令写入环境变量。

MS-DIAL

下载Linux最新版,解压后将路径添加至环境变量即可,有可能需要为主程序(MsdialConsoleApp)添加可执行权限(chmod +x MsdialConsoleApp):

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wget -c http://prime.psc.riken.jp/compms/msdial/download/repository/Linux/MSDIAL%20ver.4.9.221218%20Linuxx64.zip

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