数据库下载与构建下载1wget https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.fasta

有时候我们手里会得到一些NCBI的assession number，且数量比较多，而我们真正需要的是序列，这时候手动挨个搜索和下载是不太现实的，除非是你闲得无事可做。其实有一个网页是可以批量下载序列的，即https://www.ncbi.n

确定性过程（deterministic processes）和随机性过程（stochastic processes)是两个影响微生物群落结构系统发育组装的重要过程，本文介绍计算二者所占比例的方法。

本文阐述使用microeco分析扩增子数据……

本文阐述宏基因组物种分类、组装、bining、基因预测及注释……

BtToxin_Digger is the latest high-throughput Bacillus thuringiensis virulence factor mining pipeline on the whole network, including the basic web version and the local advanced version.

该文档可以帮助读者入门Linux系统，掌握常用命令和多种软件安装方式。此外还简述了全基因组测序技术，希望读者可以通过此文档初步了解生物信息学。

本文介绍了如何为软件添加Bioconda recipe，以便可以通过conda安装自己的软件。

为了方便广大中文用户学习PGCGAP的使用，特意书写该中文文档，但中文文档更新较慢，强烈建议大家阅读英文文档！

寻找同源蛋白家族用的比较多的是Orthomcl，但是该软件多年前已经停止更新，且使用的时候需要安装和使用MySQL，操作起来比较繁琐。因此OrthoFinder应运而生，并且更新到版本2。后者不但可以寻找同源家族，并且可以构建基因家族进化树。