简介MaAsLin 2 是 MaAsLin（微生物组多变量线性模型关联，Microbiome Multivariable Association with Linear Models）的下一代产品。 MaAsLin 2 是一个全面的 R 语

当我们要对一个多行多列的数据进行可视化的时候，分组条形图是一种不错的选择。 输入文件样式本例中数据内容如下图所示，将其保存在名为CAZy.Category.Matrix.txt的文件中。 绘图代码在Rstudio中运行如下代码，细节可根据

devtools安装错误XML包 安装之 ERROR: configuration failed for package ‘XML’ CentOS解决方案 在Linux终端中运行如下命令即可： 1sudo yum install -y li

本文演示如何在CentOS7服务器上安装Rstudio server。 安装Rstudio访问Rstudio官网，选择对应的Linux发行版，下载Rstudio安装包。本文以最常见的CentOS7为例演示，前提是系统中已经安装了R。 12w

气泡图是经常用到的一种图，可以对比不同样本中某个特征的丰富度差异。以下代码“bubbleChart_No0.R”用于气泡图的绘制，零值将不会在图中输出。 bubbleChart_No0.R代码在此123456789101112131415

为何要手绘堆叠图？QIIME2虽然可以生成堆叠图，然而图片只能在网页上查看，无法下载。此外，QIIME2的图有几分丑，且不可个性化修改，因此，手绘最靠谱。手绘当然不是用手画，而是用手敲代码。 输入文件 各级别的物种分布文件，可以直接从QII

扩增子分析较常用的软件是QIIME2，然而其生成的图并不美观，且无法下载，是不可能够达到发表要求的，因此需要我们通过其他方法将QIIME2生成的数据结果进行可视化。本文将记录相关的分析方法和示例。 准备数据 特征表（Feature tabl

在绘图过程中经常需要为不同的对象分配不同的color，然而如何得到对比度高又不唐突的color组合是一门艺术。对于不懂美术的理工男来说，希望有现成的color sets可用。

R语言作图时，默认情况下软件会按照自己的方式对坐标轴的项目进行排序，然而这种排序往往不是我们所希望的，因此需要想办法让坐标轴的项目按照我们希望的顺序输出。