EggNOG-mapper简介(本文未完待续…)EggNOG-mapper (a.k.a. emapper.py or just emapper) is a tool for fast functional annotation of no

氮（N）循环是地球生态系统中重要的生物地球化学途径的集合，在生态学和环境研究中得到了广泛的关注。目前，鸟枪法宏基因组测序Shotgun metagenome sequencing已被广泛应用于探索负责 N 循环过程的基因家族。NCycDB是

Subtitle: Predict Secretory Protein in microbes with SignalP and TMHMM 分泌蛋白Secretory Protein是指在细胞内合成后，分泌到细胞外起作用的蛋白质。分泌蛋白

III 型分泌系统 (Type III secretion system，T3SS) 主要是革兰氏阴性菌的分泌蛋白分泌到细胞外的运输途径，T3SS效应蛋白 (Type III secretion system Effector protei

软件 (Software needed) IslandPath-DIMOB BioPerl 安装 (Installation)12conda install islandpathconda install perl-bioperl 输入

CAZy数据库简介CAZy 全称为Carbohydrate-Active enZYmes Database，碳水化合物酶相关的专业数据库，内容包括能催化碳水化合物降解、修饰、以及生物合成的相关酶系家族。其包含五个主要分类：糖苷水解酶（Gly

数据库下载与构建下载1wget https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.fasta

BtToxin_Digger is the latest high-throughput Bacillus thuringiensis virulence factor mining pipeline on the whole network, including the basic web version and the local advanced version.