前言缘由网络上随处可见“某物种与人类的基因相似度高达x%”的说法。刚来P公司的时候F博曾问起过此事，初闻摸不着头脑，因为根本就不清楚说的是哪方面的相似性，讨论后一致认为这样的说法不合理。前几天需要制作一个宣传视频，F博又找我谈起了斑马鱼和人

寻找同源蛋白家族用的比较多的是Orthomcl，但是该软件多年前已经停止更新，且使用的时候需要安装和使用MySQL，操作起来比较繁琐。因此OrthoFinder应运而生，并且更新到版本2。后者不但可以寻找同源家族，并且可以构建基因家族进化树。